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vina(vina是什么意思)

发布于:2022-11-26 作者:沫沫 阅读:75

今天给各位分享vina的知识,其中也会对vina是什么意思进行解释,如果能碰巧解决你现在面临的问题,别忘了关注本站,现在开始吧!

本文目录一览:

VINA威娜吉他这款琴咋样,性价比高么?我弹了快两年吉他了,适合么?

额,vina这把琴,左轮吉他专卖店里就有,那里价格不到六百,是性价比很高的一把琴,我自己就用这样一把琴呢

但是这把琴适合初学者比较好,您弹吉他已有两年,

相比已经有一定的基础,建议选购magic这个牌子的吉他

magic的做工,木材,手感方面都是很好的吉他,德国的品牌

magic有10 20 30 40系列,依次越来越好,根据自己的经济来挑选适合自己的吧

——————图片为magic 20系列的琴

vina 翻译成中文的话应该怎么读,用汉字打出来

维娜?

翻译的话是这样的

vina

[`vi:na:]

n. 印度的七弦琴

Vina分子对接受体和配体的对接

前面已经讲完受体、配体以及对接位置的确定,下面开始正式对接的部分

1 对接文件的准备,在对接文件中写好受体、配体名称,对接中心点坐标,及距离等信息;

2 这些信息都要根据个人具体情况填写,其中有必须性和选择性填写两部分,以上为必须填写内容,可以根据vina软件说明填补其他的内容;

3 将对接文件及处理好的蛋白和配体文件放进自定义文件夹中;

4 使用命令提示符,输入命令vina --config conf.txt,即可开始分子对接过程;

5 分子对接过程开始运行,输出对接得分,以上共输出9个可能的结构,文件夹中也会输出一个out文件;

6 将输出文件放入pymol中,即可看到这9个对接结构位置;

以上就是就是整个Vina分子对接的过程,后续涉及到就是对接结果后期的图生成了,后面会慢慢向大家介绍。有问题请关注木初或者直接留言即可,谢谢大家。

vina英文名的意思

名字含义

爽朗、强迫性、心善、温柔、谦和

名字印象

大家对于(vina)的印象:是一个刚直不阿的人。 扩展资料 Vina 的名字来源历史

维纳是一个英国名字,在英语中,名称Vina的`意思是:以 vina结尾的名称

Vina 在英文地区的流行趋势

Vina稍微冷门,但很有特色,在英文国家排名第12302。2015命名人数为10千人,Vina的2016起名人数为10千人,2017命名人数为12千人。

Vina分子对接小分子配体预处理

前面的一节中,已经介绍完Vina分子对接中大分子的预处理过程;这一节中主要介绍小分子的对接前的预处理的步骤。所用到的预处理软件仍然是Autodocktools软件;

1 将已经准备的小分子配体的mol2格式文件放入默认文件夹,点击ligand-input-open;

2 在默认文件夹中点击小分子文件打开,在这个过程中自动加氢并且合并非极性氢;

3 查看小分子配体可旋转键的数目

4 该配体含有六个可旋转的键,点击Done即可;

5 点击output,将小分子文件转换成pdbqt格式;

8  已经设置后的小分子配体文件会自动保存在默认的文件夹中。

好了,以上就是Vina分子对接中小分子配体的预处理方案;有问题请下方留言或者关注木初。

Vina分子对接对接位点的确定

前面几个内容是指蛋白和小分子的处理过程,接下来一个非常重要的步骤是如何确定对接的位点,这也是整个分子对接过程中的重点。如果你能够找到原结晶的配体,那么最方便的方法就是按照共结晶配体的位置确定对接位点,如果没有,那就需要查阅文献或者根据自身的经验来确定这个对接位点。当然,目前也有很多的关于位点选择的预测方法,供大家参考。下面我们结合共结晶配体来对对接位置进行设置。

1 首先确定共结晶配体的三维结构的位置,这里面介绍个比较繁琐但是会保险一点的方法,就是根据PDB文件中的XYZ轴的数据计算下配体的在每个坐标轴的平均值,这样就大致属于配体的中心结构;由此便可以大致确定下对接位置的中心坐标

2 打开AutoDockTools,依次点击Grid-Macromolecule-Open,打开已经预处理好的蛋白文件,可以设置为卡通格式;

3 点击Grid Box,然后生成格点空间,下面开始对格点中心坐标,距离中间点的位置和格点间隔进行设置,其中格点间隔在Vina默认设置为1;

4 对格点文件进行保存;

5 将格点文件GPF保存在默认文件夹中;

好了,以上就是对接位置的设置,这是非常重要的步骤;但是大部分时候要根据自己的具体情况设置数据,但是设置的步骤就是这样的。好了,如果有问题可以关注木初专栏,互相交流。

vina的介绍就聊到这里吧,感谢你花时间阅读本站内容,更多关于vina是什么意思、vina的信息别忘了在本站进行查找喔。

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